CERT Eesti juhataja Hillar Aarelaid sõnul on CERT Eesti eesmärgiks abistada oma tegevuse kaudu Eesti interneti kasutajaid ennetavate meetmete rakendamisel vähendamaks turvaintsidentidest tekkida võivaid kahjusid ja abistada kasutajaid turvaintsidentidele reageerimisel.
Tuge osutatakse asutuste või interneti teenuse pakkuja süsteemiadministraatoritele, võrguadministraatoritele või klienditoele. Koostööd tehakse nii riigiasutuste kui erasektoriga. Lõppkasutajad peaksid turvaintsidentide korral pöörduma oma interneti teenuse pakkuja poole või siis oma organisatsiooni süsteemiadministraatorite poole, kes vajadusel teevad koostööd CERT Eestiga. CERT organisatsioonid tegutsevad ja teevad koostööd üle maailma. Eesti riigi tasemel täidab CERT ülesandeid Riigi Infosüsteemide Arenduskeskuse infoturbeintsidentide käsitlemise osakond.
